El Ministerio de Sanidad se creó entre las instituciones gubernamentales, incluidos los ministerios y las comisiones. Evolucionó a lo largo del año hasta convertirse en el Ministerio de Sanidad de la República de Sudán del Sur tras la independencia el 9 de julio de 2011. La Honorable Elizabeth Achuei es la actual Ministra de Sanidad. El Ministro ha establecido una serie de prioridades para el Ministerio desde que asumió su cargo. Esto incluye aumentar el número de trabajadores sanitarios formados, ampliar el número de centros en todo el país, mejorar la gestión, la motivación y el desarrollo de los trabajadores sanitarios y garantizar la existencia de sistemas sólidos para promover todos estos objetivos.